Hạt mè nâu cũng giống như các loại hạt mè khác, nó được dùng trong chế biến thực phẩm, cũng như trong y học.
Hạt mè nâu là nguồn cung cấp nhiều khoáng chất cần thiết cho con người như: Canxi, sắt, mangan, kẽm, magiê, selen, đồng,..
Nhiều khoáng chất trong số các khoáng chất này có vai trò quan trọng trong việc chống lão hóa xương, sản xuất tế bào hồng cầu, tổng hợp enzyme, sản xuất nội tiết tố, cũng như điều hòa các hoạt động cơ tim và xương.